Holmark Sø (dansk) eller Holmarksee (tysk) er en cirka 1,9 ha stor lavvandet sø beliggende ved Holmark syd for Flensborg i det nordlige Sydslesvig. Søen fungerede op til 1900-tallet som fiskesø. Den var med 4,05 ha lidt større end i dag. Men efter etableringen af afløb til Kilså og dermed til Trenen, reducerede sig vandarealet til nu 1,9 ha. Søen er i dag en populær badesø. I omegnen er der flere søer som Sankelmark Sø og Træsø. Landsbyer i nærheden er Lille Volstrup, Lille og Store Solt. Administrativt hører søen under Freienwill Kommune i Slesvig-Flensborg kreds i den tyske delstat Slesvig-Holsten.